粘液癌・印鑑細胞癌の研究を皮切りに、これ以外の「特殊な大腸癌」の解析も進んでいます（下表：2019年Reviewより）。
髄様癌、リンパ上皮癌、更に 低悪性度管状腺癌（LGTGA）、絨毛癌（腺腫様癌、乳頭癌）、ラブドイド癌がMSI陽性であることが解りました。今後は、これらの癌に免疫チェックポイント剤が試されるはずです。
臓器横断的化学療法
通常、抗癌剤の適応は臓器別に決められています。しかし（１）BRAF変異がある場合のRAF阻害剤の使用（２）MSI陽性の場合の免疫チェックポイント阻害剤の使用（３）Fusion遺伝子NTRAK陽性の場合のNTRAK阻害剤の使用、などは臓器は関係無く遺伝子変異から化学療法が選択されます。そして最近、保険適応もこの方向になってきています。
| 病理学的名称 | 悪性度 | 局在 | 遺伝子変化 |
| 髄様癌 | 低分化だが低い | 右 | MSI、BRAF |
| リンパ上皮癌 | 低分化だが低い | 左に多い | MSI、EBウイルス陽性 |
| GALT癌（リンパ上皮癌の 亜型という意見もあり） |
極めて低い 再発：転移の報告無し |
右＝左 | MSI陰性、EBウイルス陰性 |
| CC型（くし状、ニキビ状） | 高い | 右＝左 | 不明。MSS？,CIMP |
| 微小乳頭癌（MPA） | 高い | 直腸と右側 | p53,KRAS,CIN,BRAF |
| 低悪性度管状腺癌（LGTGA） | 低い | 右＝左 回腸にも発生する |
IDH1,KRAS,MSI 潰瘍性大腸炎に合併する |
| 絨毛癌（腺腫様癌、乳頭癌） | 低い | 直腸とS字結腸 | KRAS,MSI |
| 扁平上皮癌（SCC） | 高い | 直腸と右側 | 不明。慢性炎症と関係が深く、潰瘍性大腸炎 結腸・皮膚瘻、住血吸虫症、重複腸管に合併する |
| 明細胞癌（CCC） | 高い | 直腸とS字結腸 | KRAS,MSS。ミューラー菅由来のタイプもある |
| 肝細胞様腺癌（HepAC) | 高い | 右＝左 | 不明。迷走した肝細胞由来？血中AFP高値 |
| 絨毛癌（胎盤様癌) | 極めて高い | 右＝左 | 不明。迷走した胚細胞由来？血中HCG高値 |
| ラブドイド癌 | 極めて高い | 右側 | BRAF,MSI,SWI/SNF,centrosomeの異常 |
| 骨化癌 | 通常腺癌と同じ | 直腸 | 不明。KRAS？特別な意味は無いようだ |
| 紡錘状癌（肉腫様癌,SpCC） | 高い | 右＝左 | 不明 |
| 多型細胞癌 | 高い | 不明 | 不明 |
| 未分化癌（UC) | 高い | 右＝左 | 不明。低分化癌、印鑑細胞癌とは生物学的に異なる。 |
